Fytogeografie je mezioborová vědní disciplína studující rozšíření rostlin na Zemi. Někdy je ztotožňována s geobotanikou neboli fytocenologií, což je obor zkoumající vegetaci na úrovni rostlinných společenstev.
Hlavní součástí fytogeografie jsou botanika a geografie. Fytogeografie je součástí biogeografie. Za zakladatele tohoto oboru je považován Alexander von Humboldt.
„Fytocenologie je nauka o rostlinných společenstvech a jejich vztazích k vnějšímu prostředí.“ (J. Braun-Blanquet), zatímco „Fytogeografie je nauka o rozšíření rostlin a vegetace na Zemi v závislosti na vnějších podmínkách a jejich vývoji od nejstarších geologických dob“ (A. Humboldt).
Název je utvořen ze starořeckých slov φυτόν (phytón), rostlina, a γεωγραφία (geographía), geografie.