Begrebet indenrigsrute bruges typisk inden for luftfart om flyruter inden for et lands grænser. Afhængigt af landets størrelse, topografi og infrastruktur kan indendrigsflyvning benyttes af forskellige årsager.
- Feeder-ruter fra provinsen til større lufthavne.
- Pendlerruter fra fx øer uden fast forbindelse.
- Uvejsomt eller usikkert terræn, som gør flytransport til den mest pålidelige rejsemåde.
- Hurtigste vej mellem områder i større lande.