DNK-usmjerena DNK-polimeraza | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||
EC broj | 2.7.7.7 | ||||||||
CAS broj | 9012-90-2 | ||||||||
Baze podataka | |||||||||
IntEnz | IntEnz pregled | ||||||||
BRENDA | BRENDA unos | ||||||||
ExPASy | NiceZyme pregled | ||||||||
KEGG | KEGG unos | ||||||||
MetaCyc | metabolički put | ||||||||
PRIAM | profil | ||||||||
PDB strukture | RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum | ||||||||
Ontologija gena | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
DNK polimeraza je enzim koji katalizira proces replikacije DNK. Katalizira polimerizacijsku reakciju nukleotida u lancima molekule DNK, na osnovu postojećeg kalupa, tj. rasporeda nukleotida u komplementarnom lancu replicirajuće DNK. Novonastali polulanac DNK je komplementaran izvornom roditeljskom lancu nukleotida koji je služio kao kalup.[1][2][3][4][5][6]
Sve DNK polimeraze kataliziraju sintetezu molekula DNK u smjeru 5' → 3'. Dosad nije zabilježen niti jedna DNK polimeraza koja započne novi lanac nukleotida u suprotnom pravcu. Enzim učestvuje u dodavanju novih nukleotida na već postojeću 3-OH grupu. Zato mu je neophodan prajmer, začetak lanca na koji dograđuje prvi nukleotid. Prajmeri su DNK i RNK nukleobaze, a sintetiziraju se uz katalizu enzima primaza. Drugi enzim zvani helikaza katalizira rasplitanje dvojne spirale DNK, raskidanjem vodikovih među bazama komplementarnih nukletida, tako da se spiralno uvijeni lanaci razvlače u linearnu formu. Pritom osobitu ulogu imaju i tzv. SSB (eng. Single Strand Binding) proteini koji se vežu sa raspletenim lancem i sprečavaju ponovno vraćanje spiralne konfiguracije prije kraja procesa replikacije.
DNK polimeraza je holoenzim, jer je neophodno prisustvo iona magnezija, kao kofaktora, u aktivaciji enzima. Bez magnezija, enzim se označava kao apoenzim.
Grešake koje nastaju pri preplikaciji molekula DNK popravljaju druge DNK polimeraze, koje u reparaciji nastalih grešaka imaju editorsku funkciju, ali ne svih.
Neki virusi također kodiraju sintezu specijalnih DNK polimeraza, uz mogućnost selektivne replikacije virusne DNK. Retrovirusi imaju gene koji kodiraju neobičnu DNK polimerazu zvanu obrnuta transkriptaza (eng. Reverse Transcriptase (RT), koja zavisi od RNK, ali je ipak DNK polimeraza, jer polimerizira molekule DNK, pri čemu kao kalup ima RNK.