Aquest article tracta sobre el conjunt de microorganismes d'un medi. Vegeu-ne altres significats a «Microbiota (gènere)». |
Una microbiota és la totalitat de microorganismes, els seus elements genètics (genomes), i la interacció mediambiental dins un ambient biofísic particular. Es pot definir com una «comunitat ecològica de microorganismes comensals, simbiòtics i patògens»[1][2] que es troben en tots els organismes vius estudiats fins ara, des de plantes fins animals. Una microbiota inclou bacteris, arqueus, protists, fongs i virus. S'ha demostrat que la microbiota és fonamental per a l'homeòstasi immunitària, hormonal i metabòlica del seu hoste. El terme sinònim 'microbioma' descriu, o bé els genomes col·lectius dels microorganismes que resideixen en un nínxol mediambiental, o bé els propis microorganismes.
El terme «microbiota» va ser encunyat per Joshua Lederberg, qui argumentà que els microorganismes que habiten el cos humà podrien ser inclosos com a part del genoma humà, per la seva influència en la fisiologia humana. Es considerava que el cos humà conté unes 10 vegades més cèl·lules de microbis que no pas cèl·lules humanes,[3][4] però noves investigacions han rebaixat la proporció a 4:3.[5]
Les microbiotes són característiques també d'altres ambients, com ara els sistemes del sòl, l'aigua marina o l'aigua dolça.