El patriarca copte d'Alexandria és el cap de l'Església Ortodoxa Copta, titulat Papa d'Alexandria i Patriarca de la Predicació de Sant Marc Evangelista i de tota l'Àfrica, amb seu a Alexandria. Fins al 536, tota l'església d'Egipte estava sotmesa a l'autoritat d'un únic patriarca d'Alexandria, fins que diferències teològiques la van escindir en dues esglésies que més endavant s'anomenarien l'Església Ortodoxa d'Alexandria i Església Ortodoxa Copta, amb dues comunitats cristianes diferenciades, els melquites i els coptes, respectivament.
L'Església Copta enumera els patriarques a partir de l'evangelista Marc que va viure a Alexandria de l'any 43 al 49 i després del 61 al 67. Entre aquests dos períodes, va ordenar un bisbe, Anià, responsable de la comunitat cristiana d'aquella ciutat. Després del martiri de Marc, l'any 67, Anià el va succeir com a segon bisbe de la seu d'Alexandria.
Durant els tres primers segles de l'Església d'Alexandria, el bisbe d'Alexandria era nomenat pels sacerdots locals que n'escollien un entre ells. Més tard, i fins als nostres dies, era elegit per un Sínode que escollia entre sacerdots, monjos i ermitans. L'autoritat del bisbe d'Alexandria sobre altres diòcesis egípcies es va estendre ràpidament, i era una de les primeres autoritats eclesiàstiques que decidia sobre el nomenament de sacerdots a les diferents diòcesis. El títol de «Papa» es va donar al bisbe d'Alexandria des del pontificat de Dionís d'Alexandria cap a l'any 250.[1]