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PhagesDB

Petrischale mit bakteriellem Rasen, die klaren „Löcher“ wurden durch den Artharobacter-Phagen GantcherGoblin[1] (Morphotyp Siphoviren)[2] erzeugt

Die Actinobacteriophage Database, kurz auch als PhagesDB bezeichnet, ist eine Website und Datenbank, die Informationen über die Entdeckung, Charakterisierung und Genomik von Viren sammelt und zur Verfügung stellt, die bevorzugt Aktinobakterien-wirte. Sie dient damit dem Vergleich dieser Bakterienviren (Bakteriophagen) und ihrer Genom-Eigenschaften. Die Datenbank enthält derzeit (Stand 1. November 2023) Informationen über mehr fast 24.000 Bakteriophagen, darunter über 2.400 mit (teil-)sequenziertem Genom.[3][4][5][3]

Die PhagesDB-Daten können von frei eingesehen werden. Die Website bietet dabei verschiedene Möglichkeiten, die grundlegenden Daten abzurufen.[6][7]

Der Actinobacteriophagen-Forschung steht mit PhagesDB eine Datenbank zur Verfügung, in die sie ihre Ergebnisse zur Analyse und weiteren Forschung einstellen kann.[8][9] Zudem steht eine Programmierschnittstelle (Application Programming Interface, API) zur Verfügung.[10]

PhagesDB enthält auch Daten zu Phagenspezies und -gruppen, die vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) noch nicht offiziell bestätigt wurden, und zudem Daten zu Phagen, für die bislang noch keine Veröffentlichung vorliegt.[11]

  1. ↑ Referenzfehler: Ungültiges <ref>-Tag; kein Text angegeben für Einzelnachweis mit dem Namen GantcherGoblin.
  2. ↑ Referenzfehler: Ungültiges <ref>-Tag; kein Text angegeben für Einzelnachweis mit dem Namen Wheeler2022.
  3. ↑ a b Referenzfehler: Ungültiges <ref>-Tag; kein Text angegeben für Einzelnachweis mit dem Namen Russell2017.
  4. ↑ Referenzfehler: Ungültiges <ref>-Tag; kein Text angegeben für Einzelnachweis mit dem Namen PhagesDB.
  5. ↑ Referenzfehler: Ungültiges <ref>-Tag; kein Text angegeben für Einzelnachweis mit dem Namen Hatfull2006.
  6. ↑ Referenzfehler: Ungültiges <ref>-Tag; kein Text angegeben für Einzelnachweis mit dem Namen data.
  7. ↑ Referenzfehler: Ungültiges <ref>-Tag; kein Text angegeben für Einzelnachweis mit dem Namen Hanauer2006.
  8. ↑ Referenzfehler: Ungültiges <ref>-Tag; kein Text angegeben für Einzelnachweis mit dem Namen Hatfull2015.
  9. ↑ Referenzfehler: Ungültiges <ref>-Tag; kein Text angegeben für Einzelnachweis mit dem Namen Jordan2014.
  10. ↑ Referenzfehler: Ungültiges <ref>-Tag; kein Text angegeben für Einzelnachweis mit dem Namen api.
  11. ↑ Referenzfehler: Ungültiges <ref>-Tag; kein Text angegeben für Einzelnachweis mit dem Namen terms.

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