Farnakes II dari Pontos, juga disebut sebagai Farnakes II (bahasa Yunani: Φαρνάκης; sekitar 97–47 SM) adalah raja Kerajaan Bosporan sampai kematiannya. Ia adalah seorang penguasa berdarah Persia dan Yunani-Makedonia. Ia adalah anak bungsu dari pasangan Raja Mitridates VI dari Pontos dan istri pertamanya sekaligus saudarinya Ratu Laodice.[1] Ia lahir dan dibesarkan di Kerajaan Pontos dan mengambil nama dari kakek buyutnya Farnakes I dari Pontos. Meskipun para sejarawan kuno menyebutnya sebagai Farnakes dari Pontos, ia sebenarnya tidak memerintah Kerajaan Pontos. Setelah ayahnya dikalahkan oleh Romawi dalam Perang Mitridatik Ketiga (73–63 SM) dan wafat pada 63 SM, Romawi menganeksasi Pontos, menggabungkannya dengan bekas Kerajaan Bithynia dan membentuk provinsi Romawi Bithynia dan Pontus.