Misteri kudus atau misteri suci, atau disingkat misteri, adalah suatu area fenomena supernatural yang terkait dengan keilahian atau suatu keyakinan dan praktik keagamaan. Misteri kudus dapat berupa:
Seseorang yang memegang dan mengajarkan pengetahuan rahasia dalam pengertian nomor satu disebut juga sebagai mistagog atau hierofan, sedangkan bidang pemikiran yang bersifat filosofis atau keagamaan yang berfokus pada misteri dalam pengertian nomor dua disebut mistisisme.