Moritz Balthasar Borkhausen (Gießen, 3 dicembre 1760 – Darmstadt, 30 novembre 1806) è stato un botanico tedesco.
Partecipò alla produzione di "Teutsche Ornithologie oder Naturgeschichte aller Vögel Teutschlands in naturgetreuen Abbildungen und Beschreibungen" di Johann Conrad Susemihl.[1]
Studiò presso l'Università di Giessen, e nel 1796 iniziò a lavorare come assessore presso l'ufficio forestale di Darmstadt. Nel 1800 raggiunse il titolo di Kammerrat, seguito da un ruolo di consigliere presso il Oberforsthaus Collegium nel 1804.[2][3]
Come botanico, fu l'autore tassonomico di Alliaceae e di Asclepiadaceae.[4]