De John Muir Wilderness is een Amerikaans wildernisgebied in het Sierra Nevada-gebergte in Californië. Het wildernisgebied bestrijkt een gebied van 2.350 km² ten oosten van de bergkam in de natuurgebieden Inyo en Sierra National Forest. Het gebied bestaat uit een langgerekte strook land van zo'n 140 km op de oostelijke flank van de Sierra Nevada, alsook een arm die zich uitstrekt ten westen van het Kings Canyon National Park. Door zijn onregelmatige vorm grenst de John Muir Wilderness aan meerdere natuurgebieden in de streek, zoals Ansel Adams Wilderness in het noorden, Golden Trout Wilderness in het uiterste zuiden, en Sequoia National Park, Kings Canyon National Park, Monarch Wilderness en Dinkey Lakes Wilderness in het zuiden en westen.