De NASCAR Nextel Cup 2006 was het 58e seizoen van het belangrijkste NASCAR kampioenschap dat in de Verenigde Staten gehouden wordt en het derde jaar dat het kampioenschap doorging onder de naam Nextel Cup. Het seizoen startte op 19 februari met de Daytona 500, voorafgegaan door de exhibitiewedstrijd Budweiser Shootout en de Daytona kwalificatieraces Gatorade Duels en eindigde op 19 november met de Ford 400. Het seizoen werd voor de derde keer beslecht met de Chase for the Championship eindronde die gewonnen werd door Hendrick Motorsports-coureur Jimmie Johnson. Hij won het kampioenschap voor de eerste keer in zijn carrière. Debutant Denny Hamlin won de trofee rookie of the year.