Het wapen van Domburg heeft twee varianten gekend. Het enige verschil tussen de twee was de vormgeving van de kroon op het wapen zelf. Het wapen van de stad zou een sprekend wapen kunnen zijn: de stad heeft ooit Duinburcht geheten. Het is alleen niet bekend of er ooit echt een burcht of kasteel in de stad heeft gestaan. De burcht in het wapen kan ook symbool staan voor de stadsrechten die Domburg in het jaar 1223 van Floris IV van Holland heeft verkregen.
Sinds het oudste bekende gebruik van het wapen is het niet wezenlijk veranderd. Bekende veranderingen betreffen allemaal veranderingen aan de kroon of eventuele schildhouders. Ook de kleuren zijn niet of nauwelijks veranderd.
In 1966 is de gemeente Domburg met de gemeente Oostkapelle gefuseerd. Er is toen besloten om het oude wapen van Domburg te blijven gebruiken. In 1997 kwam aan het gebruik van het wapen een einde toen de gemeente opging in de nieuwe gemeente Veere. Na de fusie is besloten het oude wapen van Veere te blijven gebruiken waardoor het wapen van Domburg niet langer in gebruik is en ook niet op is gegaan in een ander wapen.