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A Medalha Cothenius (em alemão: Cothenius Medaille) é um prêmio de ciências concedido desde 1792 pela Academia Leopoldina, pela obra da vida de um pesquisador. Homenageia Christian Andreas Cothenius, que fundou a medalha com sua herança (com os juros de 1000 Taler em ouro), pelo melhor trabalho sobre um tema da medicina. Desde 1954 a medalha é concedida a membros da Leopoldina. Consiste em um medalha de ouro, contendo o retrato de Cothenius e a inscrição Praemium virtutis salutem mortalium provehentibus sancitum (Em reconhecimento da capacidade daqueles que promovem o bem-estar dos mortais).