BLAST

BLAST
Скриншот программы BLAST
Тип Биоинформатика
Разработчики Стивен Альтшуль, Уоррен Гиш, Вебб Миллер, Юджин Майерс и Дэвид Липман (NCBI)
Написана на C++ и Си
Операционные системы UNIX, Linux, Apple Macintosh, Microsoft Windows
Последняя версия 2.13.0 (17.03.2022)
Лицензия Public Domain
Сайт ftp.ncbi.nlm.nih.gov/bla…

BLAST (англ. Basic Local Alignment Search Tool — средство поиска основного локального выравнивания) — семейство компьютерных программ, служащих для поиска сходных аминокислотных или нуклеотидных последовательностей[1]. Используя BLAST, исследователь может сравнить имеющуюся у него последовательность с последовательностями из базы данных и найти предполагаемые гомологи. Является важнейшим инструментом для молекулярных биологов, биоинформатиков и систематиков. Программа BLAST была разработана группой учёных: Стивен Альтшуль, Уоррен Гиш, Вебб Миллер, Юджин Майерс и Дэвид Липман в системе Национальных институтов здравоохранения США. Первая публикация с описанием программы вышла в Журнале молекулярной биологии в 1990 году[2].

  1. Pertsemlidis A; Fondon JW (2001). "Having a BLAST with bioinformatics (and avoiding BLASTphemy)". Genome Biology. 2 (10): reviews2002.1. doi:10.1186/gb-2001-2-10-reviews2002. PMID 11597340.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  2. Altschul SF; Gish W; Miller W; Myers EW; Lipman DJ (1990). "Basic local alignment search tool". Journal of Molecular Biology. 215 (3): 403—410. doi:10.1016/S0022-2836(05)80360-2. PMID 2231712.

Developed by StudentB