FASTA

формат FASTA
Расширение .fas, .fasta, .fna, .ffn, .faa, .frn, .afa, .mfa
MIME-тип chemical/seq-aa-fasta, chemical/seq-na-fasta[1]
Разработчик Дэвид Липман[2]
Уильям Пирсон[2]
Опубликован 1985
Тип формата формат файла и текстовый формат данных
Расширен из ASCII for FASTA
Развит в FASTQ
Сайт ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/fasta.shtml

FASTA — текстовый формат для нуклеотидных или полипептидных последовательностей, в котором нуклеотиды или аминокислоты обозначаются при помощи однобуквенных кодов. Из-за своей простоты и практичности в настоящее время используется большинством программ работы с биологическими последовательностями. Файлы данного формата могут содержать названия последовательностей, их идентификаторы в базах данных и комментарии. В зависимости от природы содержащихся в нем биологических последовательностей файл формата FASTA может иметь различные расширения.

  1. FASTA (.fasta, .fa, .fna, .fsa, .mpfa). Wolfram Research, reference, 2007-2012. Дата обращения: 19 июня 2015. Архивировано 19 июня 2015 года. (англ.)
  2. 1 2 Lipman D., Pearson W. Rapid and sensitive protein similarity searches (англ.) // Science. — 1985. — 22 March (vol. 227, no. 4693). — P. 1435—1441. — ISSN 0036-8075. — doi:10.1126/science.2983426. [исправить]

Developed by StudentB