Ontologija gena, engl. Gene Ontology ili GO, je značajna bioinformatička inicijativa da se ujedini reprezentacija gena i atributa genskih produkata kod svih vrsta[1]. Projekat ontologije gena ima tri cilja:
GO je deo deo većeg klasifikacionog poduhvata pod nazivom Otvorena biomedicinska ontologija, engl. Open Biomedical Ontologies (OBO).