Zastava Malte je vertikalna dvobojka jednake veličine polja, sa belom bojom ka jarbolu. Ta dvobojnost prisutna je i na grbu Malte. Tradicionalno se smatra da ove boje zastave potiču od grofa Rožea I od Sicilije iz 1091. godine, ali je ovo samo legenda koja se razvila tokom vremena.
U gornjem jarbolnom kantonu nalazi se krst sv. Đorđa, uokviren crveno. Ovaj orden dodeljen je Malti za izuzetnu hrabrost tokom Drugog svetskog rata. Ovakva zastava usvojena je po nezavisnosti Malte 21. septembra 1964. godine. Po tome što na zastavi ima orden druge države malteška zastava je jedinstvena u svetu.
Civilna zastava je potpuno drugačija: sastoji se iz crvenog polja sa belim obrubom na kome se nalazi Malteški krst.