ChEBI

ChEBI

Vsebina
Opis	Kemijska podatkovna zbirka
Tipi zajetih podatkov	Chemical Entities of Biological Interest
Kontakt
Raziskovalni center	European Molecular Biology Laboratory
Laboratorij	European Bioinformatics Institute
Glavni citat	[1]
Dostop
Spletna stran	ChEBI
URL za prenos	Downloads
Web service URL	Web Service
Sparql dostopna točka	BIO2RDF
Orodja
Web	ChEBI Website
Razno
obnavljanje podatkov	mesečno
stališče do kuratiranja	Manually curated

Biološko pomembne kemijske entitete (iz angleškega Chemical Entities of Biological Interest)^[2][3] je zbirka podatkov in ontologij molekularnih entitet, osredotočena predvsem na »majhne« kemijske spojine.

Izraz »molekularna entiteta« zajema »vse atome in njihove izotope, molekule, ione, ionske pare, radikale, radikalske ione, komplekse, konformacije itd., ki so prepoznavni kot samostojni subjekti«.^[4] Molekularne entitete so bodisi naravni ali sintetični produkti, ki imajo potencialno biološko aktivnost. Gensko kodirane molekule, kot so nukleinske kisline, proteini in peptidi, ki nastajajo s proteolizo, se praviloma ne vnašajo v ChEBI.

1. ↑ de Matos P, Alcántara R, Dekker A, Ennis M, Hastings J, Haug K, Spiteri I, Turner S, Steinbeck C (Januar 2010). »Chemical Entities of Biological Interest: an update«. Nucleic Acids Research. 38 (Database issue): D249-54. doi:10.1093/nar/gkp886. PMC 2808869. PMID 19854951.
2. ↑ P. De Matos, R. Alcantara, A. Dekker, M. Ennis, J. Hastings, K. Haug, I. Spiteri, S. Turner, C. Steinbeck (2009). Chemical Entities of Biological Interest: An update. Nucleic Acids Research 38: D249–54. DOI: 10.1093/nar/gkp886.PMID 19854951.
3. ↑ K. Degtyarenko, P. De Matos, M. Ennis, J. Hastings, M. Zbinden, A. McNaught, R. Alcantara, M. Darsow in drugi (2007). ChEBI: A database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Research 36: D344–50. doi:10.1093/nar/gkm791. PMC 2238832. PMID 17932057.
4. ↑ molecular entity. IUPAC, Compendium of Chemical Terminology, 2. izdaja, 1997.